Centre de calcul du laboratoire
(mise à jour 22 janvier 2021)
Responsable
Laurent COURNÈDE
Le centre de calcul se compose d'un ensemble d'ordinateurs dont les ressources mises en commun permettent aux modélisateurs de l'IMN d'augmenter leur puissance de calcul.
Caractéristiques techniques
Les calculateurs sont classés en niveaux "tier" : pour un calculateur local tel que celui du laboratoire, c'est le tier-3. Il est complémentaire du calculateur régional CCIPL (mésocentre, tier-2) et des centres nationaux (tier-1). Il permet l'initiation à la modélisation (stagiaires, doctorants) ou la mise en œuvre de calculs parallèles de petites tailles. La grappe de calcul de l’Institut est composée de 24 machines - dont 22 nœuds de calcul - interconnectées par un réseau dédié rapide (réseau « Infiniband » à 40 Gb/s). Le stockage des données de calcul offre une capacité de 7 To (stockage permanent) et de 13 To pour les résultats intermédiaires ("scratch") ; elle possède 304 cœurs avec 4 Go RAM/cœur disponibles pour les calculs :
- 12 nœuds bi-processeur intel Xeon E5-2620, 6 cœurs
- 10 nœuds bi-processeur intel Xeon Silver 4110, 8 cœurs
Cette grappe est située dans une salle climatisée afin de maintenir une température de fonctionnement optimale. Elle est protégée par un onduleur afin de ne pas subir de variations électriques intempestives.
Conditions d’accès
Toute personne de l’IMN peut obtenir un compte sur le calculateur de l’IMN sans condition. La soumission des travaux de calcul est possible depuis une machine connectée au réseau du laboratoire ou à travers le VPN depuis l’extérieur (du laboratoire).
Logiciels disponibles
Tout logiciel détenu par le laboratoire peut être compilé sur le calculateur. Les codes suivants sont déjà installés et disponibles à chacun :
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- AIMPRO
- VASP
- Wien2K
- GAUSSIAN
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Codes de dynamique moléculaire :
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- LAMMPS
- GULP
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Codes thermodynamiques/statistiques :
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- ATAT
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Outils de visualisation :
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- ATOMEYE
- jMol
- Avogadro
- VMD
- Diamond
- VESTA
- OVITO
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